La Chambre d’Agriculture de l’Yonne dispose d’un budget annuel de fonctionnement de l’ordre de 4,6 Millions d’euros.

Ses ressources principales sont les suivantes :

- le produit de la taxe pour frais de Chambre d’Agriculture à hauteur d’environ 54% : l’Yonne se situe au 94 ème rang des départements français pour l’importance du taux de la taxe pour frais de Chambre d’Agriculture qui en 2008 représentait 5,74 €  par hectare de Surface Agricole Utile (écart nationaux de 3,99 à 33,62 €),

- les subventions publiques (Europe, Etat, Région, Département, …) à hauteur d’environ 21%

- les facturations de prestations de service et autres produits à hauteur d’environ 25%.