La Chambre d’Agriculture est la seule structure départementale représentative de l’ensemble des composantes du secteur de l’agriculture et de la forêt. Ses membres sont élus pour une durée de six ans à l’issue d’un scrutin professionnel qui s’effectue à partir de plusieurs collèges. La Chambre d’Agriculture de l’Yonne est administrée par une assemblée de 46 membres dont 2 administrateurs du CRPF (désignés par le Centre Régional de la Propriété Forestière) et 44 membres élus dans les collèges suivants :

collège des chefs d'exploitation et associés : 21 membres

collège des anciens exploitants : 2 membres

collège des propriétaires agricoles et usufruitiers : 2 membres

collège des salariés agricoles et d'organismes agricoles : 8 membres

collège des groupements professionnels (syndicalisme, crédit, coopération, mutualité) : 11 membres

La Chambre d’Agriculture de l’Yonne comprend par ailleurs 8 membres associés désignés sur proposition de son Président pour leur représentativité complémentaire (comptabilité agricole, tourisme rural, syndicalisme professionnel, protection de l’environnement, politique foncière). Les Chambres d’Agriculture sont organisées en réseau régional et national au travers de 21 Chambres Régionales d’Agriculture et d’une tête de réseau national : l’APCA (Assemblée Permanente des Chambres d'Agriculture).